Le transcriptome fait référence à l'ensemble des ARN présents dans une cellule ou un tissu à un moment donné. Il représente toutes les molécules d'ARN qui sont transcrites à partir de l'ADN dans une cellule donnée.
L'expression des gènes est régulée au niveau transcriptionnel, ce qui signifie que seuls certains gènes sont activement transcrits en ARN. Le transcriptome permet donc d'obtenir une vision globale des gènes qui sont actifs dans une cellule ou un tissu spécifique, à un moment précis.
La caractérisation du transcriptome est réalisée à l'aide de méthodes de séquençage de nouvelle génération, telles que le séquençage d'ARN (RNA-seq). Cette technique permet de séquencer des millions d'ARN individuels à partir d'un échantillon et de quantifier leur expression relative. Cela permet d'identifier les gènes qui sont fortement exprimés, ainsi que ceux dont l'expression est faible.
L'analyse du transcriptome est essentielle pour comprendre les mécanismes moléculaires régulant le développement cellulaire, la différenciation tissulaire et les réponses aux stimuli environnementaux. Il permet également d'identifier et de caractériser les biomarqueurs spécifiques de certaines conditions pathologiques, comme le cancer ou les maladies neurodégénératives.
En résumé, le transcriptome est l'ensemble des ARN présents dans une cellule ou un tissu à un moment donné, et sa caractérisation est essentielle pour comprendre la biologie cellulaire et identifier des biomarqueurs diagnostiques ou thérapeutiques.
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